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Text File  |  1995-07-25  |  1.7 KB  |  37 lines
  1. ************************************
  2. * Cytosol aminopeptidase signature *
  3. ************************************
  4.  
  5. Cytosol  aminopeptidase is a eukaryotic cytosolic  zinc-dependent exopeptidase
  6. that catalyzes  the removal  of unsubstituted  amino-acid  residues  from  the
  7. N-terminus of proteins. This enzyme is  often  known as leucine aminopeptidase
  8. (EC 3.4.11.1) (LAP)  but  has  been shown [1]  to  be  identical  with  prolyl
  9. aminopeptidase (EC 3.4.11.5). Cytosol aminopeptidase is a hexamer of identical
  10. chains, each of which binds two zinc ions.
  11.  
  12. Cytosol aminopeptidase is highly similar to Escherichia coli pepA, a manganese
  13. dependent aminopeptidase.  Residues  involved  in  zinc ion-binding [2] in the
  14. mammalian enzyme are  absolutely  conserved in pepA where they presumably bind
  15. manganese.
  16.  
  17. A cytosol  aminopeptidase  from    Rickettsia  prowazekii  [3]  and  one  from
  18. Arabidopsis thaliana also belong to this family.
  19.  
  20. As a signature pattern  for these  enzymes, we  selected a perfectly conserved
  21. octapeptide which  contains  two  residues  involved in binding metal ions: an
  22. aspartate and a glutamate.
  23.  
  24. -Consensus pattern: N-T-D-A-E-G-R-L
  25.                     [The D and the E are zinc/manganese ligands]
  26. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  27. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  28. -Last update: October 1993 / Text revised.
  29.  
  30. [ 1] Matsushima M., Takahashi T., Ichinose M., Miki K., Kurokawa K.,
  31.      Takahashi K.
  32.      Biochem. Biophys. Res. Commun. 178:1459-1464(1991).
  33. [ 2] Burley S.K., David P.R., Sweet R.M., Taylor A., Lipscomb W.N.
  34.      J. Mol. Biol. 224:113-140(1992).
  35. [ 3] Wood D.O., Solomon M.J., Speed R.R.
  36.      J. Bacteriol. 175:159-165(1993).
  37.